売り掛け代金の少額訴訟で、入金チェックミスをして１０万程多く訴訟に記載してしまいました。多く受け取るつもりは無くミスである事を素直に申告するつもりなのですが、このような場合どのような扱いになるでしょうか？

訴訟の開始される前に、裁判所に請求額の訂正を申し出る書類を出せばいいんじゃないですか？可能かどうか裁判所できいた方がいいと思います。

裁判が続いているうちに訴えの変更申立書を提出すれば、そのまま裁判ができます。

http://abikotouki.blog47.fc2.com/blog-date-200606.html

このページの途中に、ちょっとした書式がありました。新たな請求金額に対する収入印紙がまた必要になるようです。

3.受理され本案の審理がされます（他の要件に問題がなければ）。

入金のチェックミスとのことから推察して、答えさせていただきますと、準備書面で10万円については弁済済である旨自白すれば良いのではないでしょうか？

3です。

あくまで私見ですが、書面で良いのではないでしょうか。

「書面の通り陳述します。」と言うことで効果が発生するので、結果的には同じことですが。